При данном синдроме (СФД) дети получают дифференцированную терапию в зависимости от выявленных изменений. Прежде всего, проводится базисная терапия. Дети с синдромом функциональной диспепсии употребляют пищу часто, малыми порциями. Из их рациона исключаются острые, копченые, жареные, жирные блюда, острые приправы, сладости, газированные напитки, кофе, продукты с консервантами.
В случае гипомоторных нарушений моторно-эвакуаторной функции назначается препарат группы прокинетиков.
В случае гипермоторных нарушений — препарат группы миотропных спазмолитиков во время приема пищи. Для коррекции изменений кислотообразующей функции предназначаются антисекреторные и антацидные препараты. При наличии умеренной гиперацидности при гипо- или гипермоторных изменениях моторно-эвакуаторной функции желудка назначается терапевтический комплекс, состоящий из комбинации антацида и прокинетиков или миотропных спазмолитиков. В случаях выраженной гиперацидности и гипо- или гипермоторных изменениях моторно-эвакуаторной функции желудка — ингибитор протонной помпы один раз в сутки и прокинетик или миотропные спазмолитики в соответствии с курсом на 7-10 дней. При наличии высокого ИН кардиограммы (в случае симпатикотонии) назначается дарсонвализация — 10 сеансов, массаж, гальванизация на область желудка — курсом на 10 дней, подводный душ-массаж курсом на 10 дней.
Лечение психоэмоциональных изменений осуществляют в сотрудничестве с психиатрами и психологами. В частности, медикаментозная коррекция состояния тревожности проводится строго по показаниям с помощью седативных препаратов растительного происхождения. Кроме этого, всем детям в зависимости от характера психоэмоциональных изменений проводятся сеансы музыкотерапии — прослушивание фрагментов классических музыкальных композиций: «Свет луны» Дебюсси, «Серенада» Шуберта, произведений Моцарта, Листа, Шумана, Чайковского — минимум полчаса три раза в неделю курсом на 10-15 дней. Также проводится индивидуальная коррекция психоэмоциональных изменений: аутотренинг — три раза в неделю в течение четырех недель, рациональная групповая и индивидуальная психотерапия – около трех раз в неделю в течение четырех недель.
При очень низкой и низкой тревожности дети получают два травяных сбора: желудочный сбор № 3 — 1/3 стакана два раза в день за двадцать минут до еды курсом 2 недели; успокоительный сбор № 2 — по 1/4 стакана два раза в день за полчаса до еды курсом 2 недели. При умеренной тревожности дети с гиперкинетическим вариантом синдрома функциональной диспепсии получают настой валерианы по пятнадцать капель четыре раза в день внутрь в течение двух недель, с гипокинетическим вариантом — настой пустырника по тридцать капель четыре раза в день до еды в течение двух недель. Эффективность лечения детей с СФД оценивается не только по положительной динамике основных клинических и параклинических показателей в течение 14 дней лечения, но и по данным катамнеза в течение двух лет.